La Colección de Invertebrados Fósiles del Museo de Historia Natural, es una de las mas importantes de nuestro país, por su valor histórico – científico. Está conformada por la Colección científica Antonio Raimondi, Bernardo Boit, Axel Olsson y la Colección “Varias” con un total de aproximadamente 4,000 muestras (aproximadamente 20,000 especímenes) y, tantas especies tipo.

Los invertebrados fósiles son de gran valor estratigráfico pues muchos de ellos son fósiles guía. Un Fósil guía determina la edad relativa de las rocas sedimentarias donde se encuentra, para tal fin tiene que cumplir ciertos requisitos como: Tener un corto rango vertical (es decir haber vivido poco tiempo) y haber tenido un amplio rango horizontal (es decir de amplia distribución geográfica); entre ellos se tiene a los amonites, graptolitos, trilobites, corales y algunos bivalvos y gasterópodos fósiles.

La paleofauna procede de los diferentes departamentos del Perú e incluye fósiles del Ordovícico al Reciente:

Didymograptus sp. (Graptolito)
Ordovícico – Ambo, Huánuco

Metacryphaeus australis (Trilobite)
Devónico - Puno

Platyceras sp.(Gasterópodo)
Devónico - Puno

Delphinula numida (Gasterópodo)
Senónico de Amazonas

Lenticeras gabbi (Amonite)
Senónico de Amazonas

Turritella infracarinata (Gasterópodo)
Mioceno – Zorritos, Tumbes

Bosque fósil de Sexi - Santa Cruz
Cajamarca del Eoceno Medio

Corte transversal del tallo silicificado de una planta Angiosperma