El Museo de Historia Natural, se inauguró en 1918 con las secciones de Zoología, Botánica y Mineralogía. Sus jefes integraron las primeras expediciones científicas colectando las muestras de la riqueza natural peruana, que sirvieron como primer material de estudio.

La primera expedición científica universitaria la organizó su primer director Carlos Rospigliosi, aportando materiales de fauna, flora y minerales de Junín y Huánuco.

En el transcurso de los años se han realizado centenas de expediciones a diversos lugares del país para obtener valiosas muestras de nuestra fauna terrestre y acuática que enriquecen las colecciones zoológicas y que actualmente son objeto de estudio para nuestros egresados y también motivo de consulta para especialistas nacionales y extranjeros.