Los servicios que ofrece el Museo a la comunidad en general son de los más diversos. Brinda a personas particulares, entidades estatales y privadas, nacionales y extranjeras, asesoría, consultoría y diagnóstico sobre temas que son de su competencia tales como: identificación, conservación, protección y uso racional o sustentable de los recursos naturales; estudios de impacto ambiental, así como el de la evaluación crítica de la biodiversidad. Esto es de importancia fundamental y trascendente en nuestros días dado que se conoce que el Perú es uno de los diez países megadiversos del planeta y para algunos investigadores, es el primero.

Ofrece también educación por medio de sus exhibiciones permanentes y temporales, así como a través del dictado de cursos y cursillos, la de su biblioteca especializada, considerada la más completa de su género en el Perú.

El Museo ha sido, es y será además, foro cotidiano para la discusión de temas trascendentes de nuestra realidad, para lo cual cuenta con un auditorio para 250 personas cómodamente ubicadas.

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